Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacna1eQ61290 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cacna1eQ61290 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms