Protein–RNA interactions for Protein: Q61146

Ocln, Occludin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OclnQ61146 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OclnQ61146 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OclnQ61146 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OclnQ61146 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OclnQ61146 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OclnQ61146 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OclnQ61146 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms