Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usf1Q61069 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Usf1Q61069 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Usf1Q61069 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Usf1Q61069 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Usf1Q61069 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Usf1Q61069 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usf1Q61069 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms