Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd3Q61060 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Foxd3Q61060 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Foxd3Q61060 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms