Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpc1Q61056 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms