Protein–RNA interactions for Protein: Q60I26

Als2cl, ALS2 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2clQ60I26 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Als2clQ60I26 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms