Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbbp4Q60972 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms