Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms