Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Traf3Q60803 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms