Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdkn2dQ60773 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2dQ60773 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms