Protein–RNA interactions for Protein: Q60769

Tnfaip3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip3Q60769 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfaip3Q60769 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms