Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Samhd1Q60710 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Samhd1Q60710 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms