Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Foxd4Q60688 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd4Q60688 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms