Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ClpbQ60649 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms