Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD0

Rflnb, Refilin-B, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RflnbQ5SVD0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RflnbQ5SVD0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RflnbQ5SVD0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms