Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc42Q5SV66 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms