Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sco1Q5SUC9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sco1Q5SUC9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms