Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sft2d1Q5SSN7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms