Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Utp18Q5SSI6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Utp18Q5SSI6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms