Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
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Gm11487Q5RIS0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
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Gm11487Q5RIS0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Gm11487Q5RIS0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Gm11487Q5RIS0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Gm11487Q5RIS0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Gm11487Q5RIS0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Gm11487Q5RIS0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Gm11487Q5RIS0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Gm11487Q5RIS0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Gm11487Q5RIS0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm11487Q5RIS0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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