Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RilpQ5ND29 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms