Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5431Q5NCB3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5431Q5NCB3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms