Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJS3

Fam20c, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20cQ5MJS3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam20cQ5MJS3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms