Protein–RNA interactions for Protein: Q5M6W3

Clhc1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clhc1Q5M6W3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clhc1Q5M6W3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clhc1Q5M6W3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms