Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chsy3Q5DTK1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chsy3Q5DTK1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Chsy3Q5DTK1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chsy3Q5DTK1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms