Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syce1lQ5D525 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syce1lQ5D525 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms