Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spire1Q52KF3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms