Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA2

Cdv3, Protein CDV3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdv3Q4VAA2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdv3Q4VAA2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms