Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm10488Q4KL05 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm10488Q4KL05 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm10488Q4KL05 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm10488Q4KL05 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms