Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krt35Q497I4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krt35Q497I4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms