Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms