Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmed1Q3V009 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmed1Q3V009 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms