Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrfip1Q3UZ39 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrfip1Q3UZ39 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms