Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc160Q3UYG1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms