Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Pfdn4Q3UWL8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pfdn4Q3UWL8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pfdn4Q3UWL8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pfdn4Q3UWL8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pfdn4Q3UWL8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pfdn4Q3UWL8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pfdn4Q3UWL8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pfdn4Q3UWL8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pfdn4Q3UWL8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pfdn4Q3UWL8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Pfdn4Q3UWL8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pfdn4Q3UWL8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pfdn4Q3UWL8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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