Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr1d1Q3UV55 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms