Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Znf48Q3US17 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms