Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Nhlrc4Q3UP44 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlrc4Q3UP44 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms