Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Skap2Q3UND0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Skap2Q3UND0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms