Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pin1rt1Q3ULQ2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms