Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CrxosQ3UL53 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms