Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc61Q3UJV1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms