Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rmdn3Q3UJU9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms