Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc34Q3UI66 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc34Q3UI66 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms