Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 440.5 ms