Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms