Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U6N9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U6N9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U6N9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U6N9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U6N9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U6N9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U6N9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U6N9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U6N9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q3U6N9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U6N9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q3U6N9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms