Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q3U595 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U595 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U595 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U595 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U595 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U595 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U595 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U595 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U595 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U595 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U595 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U595 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U595 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U595 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U595 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U595 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U595 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U595 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U595 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U595 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U595 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U595 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U595 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q3U595 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q3U595 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q3U595 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q3U595 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms