Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LcorlQ3U285 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms