Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srsf6Q3TWW8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms